Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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RNF182Q8N6D2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RNF182Q8N6D2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RNF182Q8N6D2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RNF182Q8N6D2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RNF182Q8N6D2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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RNF182Q8N6D2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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RNF182Q8N6D2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF182Q8N6D2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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