Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHCHD4Q8N4Q1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHCHD4Q8N4Q1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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