Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTU1Q7Z7A3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms