Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS2ST1Q7LGA3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms