Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BBS12Q6ZW61 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms