Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms