Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM4Q6P4Q7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms