Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC42EP5Q6NZY7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms