Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLX4IPQ5VYV7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLX4IPQ5VYV7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms