Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH2Q5VUJ6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms