Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAVIN4Q5BKX8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms