Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC178Q5BJE1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC178Q5BJE1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms