Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRDTQ58F21 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms