Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms