Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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