Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNOP1Q1ED39 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNOP1Q1ED39 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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