Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B3Q15393 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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