Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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