Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DDX39BQ13838 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DDX39BQ13838 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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