Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXE3Q13461 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXE3Q13461 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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