Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3B2Q13435 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
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