Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP2Q13309 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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