Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSTF3Q12996 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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