Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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