Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-203ENST00000472367 794 ntTSL 316.12■□□□□ 0.174e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-212ENST00000483588 688 ntTSL 315.69■□□□□ 0.14e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-229ENST00000584177 574 ntTSL 415.01□□□□□ -0.014e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-217ENST00000497774 1662 ntTSL 512.9□□□□□ -0.344e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.44e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.44e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.464e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.564e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-219ENST00000578757 920 ntTSL 1 (best)10.97□□□□□ -0.654e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-206ENST00000477249 891 ntTSL 510.97□□□□□ -0.654e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-215ENST00000491009 863 ntTSL 210.74□□□□□ -0.694e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.864e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-207ENST00000478103 712 ntTSL 39.32□□□□□ -0.924e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-227ENST00000583400 712 ntTSL 48.85□□□□□ -0.994e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -14e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-204ENST00000475947 598 ntTSL 28.11□□□□□ -1.114e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-201ENST00000460249 773 ntTSL 38.11□□□□□ -1.114e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-222ENST00000580770 572 ntTSL 48.11□□□□□ -1.114e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-230ENST00000584926 604 ntTSL 57.32□□□□□ -1.244e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-221ENST00000580180 753 ntTSL 27.05□□□□□ -1.284e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.364e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-211ENST00000483140 936 ntTSL 25.5□□□□□ -1.534e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-210ENST00000481898 993 ntTSL 1 (best)5.28□□□□□ -1.564e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-216ENST00000492250 565 ntTSL 53.81□□□□□ -1.84e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 11e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 56.86□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 ABCC6-206ENST00000576683 476 ntTSL 312.5□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.872e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 PICK1-214ENST00000484021 2531 ntTSL 223.98■■□□□ 1.432e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 ACADVL-216ENST00000578824 720 ntTSL 29.19□□□□□ -0.943e-10■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 ACADVL-213ENST00000578579 458 ntTSL 35.27□□□□□ -1.573e-10■■■■■ 28.9
SF3A3Q12874 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.541e-10■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.631e-10■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.241e-10■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 COL27A1-205ENST00000485397 463 ntTSL 516.31■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 MTMR4-201ENST00000323456 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 IGF2BP2-205ENST00000461957 509 ntTSL 512.79□□□□□ -0.365e-9■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.294e-7■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PIGQ-208ENST00000443147 2054 ntTSL 222.05■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PIGQ-218ENST00000635909 2212 ntTSL 520■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PIGQ-211ENST00000480424 2202 ntTSL 218.59■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 517.5■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PIGQ-220ENST00000636005 1355 ntTSL 513.85□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PIGQ-217ENST00000635205 936 ntTSL 513.59□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PIGQ-222ENST00000637468 650 ntTSL 513.29□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 PIGQ-213ENST00000540241 608 ntTSL 312.01□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 CCNL2-209ENST00000471930 846 ntTSL 511.19□□□□□ -0.627e-14■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.314e-8■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 CAT-202ENST00000525707 562 ntTSL 27.74□□□□□ -1.174e-8■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 CAT-204ENST00000530343 752 ntTSL 24.29□□□□□ -1.724e-8■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 C3-217ENST00000602053 621 ntTSL 27.61□□□□□ -1.198e-45■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 314.11□□□□□ -0.153e-15■■■■■ 28.8
SF3A3Q12874 TNFRSF14-212ENST00000475523 1645 ntTSL 1 (best)20.66■□□□□ 0.99e-9■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.659e-9■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 TNFRSF14-210ENST00000466750 2603 ntTSL 219.07■□□□□ 0.649e-9■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 TNFRSF14-205ENST00000435221 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.96■□□□□ 0.319e-9■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.149e-9■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 TNFRSF14-207ENST00000451778 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.02□□□□□ -0.179e-9■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 TNFRSF14-204ENST00000434817 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.49□□□□□ -0.259e-9■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 TNFRSF14-216ENST00000496064 1480 ntTSL 213.42□□□□□ -0.269e-9■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 TNFRSF14-208ENST00000463471 4255 ntTSL 213.25□□□□□ -0.299e-9■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 TNFRSF14-203ENST00000426449 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.59□□□□□ -0.559e-9■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 TNFRSF14-211ENST00000471768 539 ntTSL 311.33□□□□□ -0.69e-9■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 HDLBP-215ENST00000427487 924 ntTSL 511.35□□□□□ -0.595e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 HDLBP-237ENST00000479169 1017 ntTSL 29.05□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 HDLBP-228ENST00000459788 563 ntTSL 28.55□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 EPS8L2-202ENST00000524474 907 ntTSL 217.41■□□□□ 0.385e-8■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 EPS8L2-207ENST00000526651 572 ntTSL 415.74■□□□□ 0.115e-8■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 PLOD3-205ENST00000440925 536 ntTSL 414.13□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 518.55■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 MTHFD1-204ENST00000553405 833 ntTSL 213.83□□□□□ -0.29e-8■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.357e-13■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 SLC25A36-205ENST00000502594 1163 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.037e-13■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.197e-13■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 SLC25A36-212ENST00000513887 578 ntTSL 313.82□□□□□ -0.27e-13■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.237e-13■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 SLC25A36-215ENST00000631654 620 ntTSL 512.79□□□□□ -0.367e-13■■■■■ 28.7
Retrieved 100 of 27,864 protein–RNA pairs in 151.5 ms