Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STX4Q12846 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
STX4Q12846 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
STX4Q12846 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
STX4Q12846 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms