Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YPL261CYPL261C 309 nt0.63□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 UTP10YJL109C 5310 nt0.62□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.62□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 INP2YMR163C 2118 nt0.62□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YHL042WYHL042W 453 nt0.61□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 ISF1YMR081C 1017 nt0.61□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YNL058CYNL058C 951 nt0.61□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 ATP19YOL077W-A 207 nt0.61□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.6□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YOR282WYOR282W 321 nt0.6□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 CUL3YGR003W 2235 nt0.59□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 INA22YIR024C 651 nt0.59□□□□□ -2.31
SNF8Q12483 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.58□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 MAM33YIL070C 801 nt0.58□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 MRPL50YNR022C 420 nt0.58□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 YBR064WYBR064W 429 nt0.58□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 ECM12YHR021W-A 456 nt0.57□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 YIR044CYIR044C 186 nt0.56□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 YJR011CYJR011C 786 nt0.56□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 YLL007CYLL007C 1998 nt0.56□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 LTE1YAL024C 4308 nt0.55□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 ATG31YDR022C 591 nt0.55□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 RPS20YHL015W 366 nt0.55□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 MCM10YIL150C 1716 nt0.55□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 RPL38YLR325C 237 nt0.54□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 YBR206WYBR206W 324 nt0.54□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 NPR2YEL062W 1848 nt0.54□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 PMP1YCR024C-A 123 nt0.53□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 OLI1Q0130 231 nt0.53□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 RPS24BYIL069C 408 nt0.53□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 NOP9YJL010C 2001 nt0.53□□□□□ -2.32
SNF8Q12483 CHS6YJL099W 2241 nt0.53□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 YML002WYML002W 2214 nt0.52□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.52□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 YPL044CYPL044C 549 nt0.52□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.52□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 OST1YJL002C 1431 nt0.52□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 YCK3YER123W 1575 nt0.51□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.51□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 YDR426CYDR426C 378 nt0.5□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 YOR029WYOR029W 336 nt0.5□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 PTP2YOR208W 2253 nt0.49□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 NIP100YPL174C 2607 nt0.49□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 BSC3YLR465C 309 nt0.49□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 RPS30BYOR182C 192 nt0.48□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 YLR456WYLR456W 615 nt0.47□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 YPL185WYPL185W 396 nt0.47□□□□□ -2.33
SNF8Q12483 RPL26BYGR034W 384 nt0.46□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 YLR434CYLR434C 384 nt0.46□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 YOR218CYOR218C 420 nt0.46□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.45□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 YMR160WYMR160W 2451 nt0.45□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 STF2YGR008C 255 nt0.44□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.44□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.43□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 PCC1YKR095W-A 267 nt0.42□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 SPO21YOL091W 1830 nt0.41□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 HUG1YML058W-A 207 nt0.41□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 YNL211CYNL211C 261 nt0.41□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.41□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 YPL068CYPL068C 882 nt0.41□□□□□ -2.34
SNF8Q12483 YJL007CYJL007C 315 nt0.4□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 YSP1YHR155W 3687 nt0.4□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 ASE1YOR058C 2658 nt0.4□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 PAA1YDR071C 576 nt0.39□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 FYV10YIL097W 1551 nt0.39□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.38□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 YOR053WYOR053W 342 nt0.38□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 SGF11YPL047W 300 nt0.38□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 YPL205CYPL205C 345 nt0.38□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 BEM3YPL115C 3387 nt0.37□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 YLR334CYLR334C 381 nt0.37□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 MLP1YKR095W 5628 nt0.37□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 HMRA2YCR096C 360 nt0.36□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 CSN9YDR179C 489 nt0.36□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 SBH1YER087C-B 249 nt0.36□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.36□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 MYO1YHR023W 5787 nt0.36□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 YMR321CYMR321C 318 nt0.35□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 PET111YMR257C 2403 nt0.35□□□□□ -2.35
SNF8Q12483 YKL063CYKL063C 504 nt0.34□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 VPS20YMR077C 666 nt0.34□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 PAU12YGR294W 363 nt0.33□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YAR029WYAR029W 225 nt0.33□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 TAR1YLR154W-C 375 nt0.33□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 RPS25BYLR333C 327 nt0.33□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YPL225WYPL225W 441 nt0.33□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 COX5BYIL111W 456 nt0.32□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.32□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 ABF2YMR072W 552 nt0.32□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.32□□□□□ -2.36
SNF8Q12483 MLP2YIL149C 5040 nt0.32□□□□□ -2.36
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