Protein–RNA interactions for Protein: Q12090

REX3, RNA exonuclease 3, yeastyeast

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REX3Q12090 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.71□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.71□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
REX3Q12090 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.71□□□□□ -2.3
REX3Q12090 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.7□□□□□ -2.3
REX3Q12090 CMC4YMR194C-B 222 nt0.7□□□□□ -2.3
REX3Q12090 GEA2YEL022W 4380 nt0.7□□□□□ -2.3
REX3Q12090 YDR521WYDR521W 336 nt0.69□□□□□ -2.3
REX3Q12090 ECM12YHR021W-A 456 nt0.69□□□□□ -2.3
REX3Q12090 RPL26AYLR344W 384 nt0.69□□□□□ -2.3
REX3Q12090 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.69□□□□□ -2.3
REX3Q12090 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.69□□□□□ -2.3
REX3Q12090 snR41snR41 95 nt0.69□□□□□ -2.3
REX3Q12090 YLL007CYLL007C 1998 nt0.68□□□□□ -2.3
REX3Q12090 PMP1YCR024C-A 123 nt0.68□□□□□ -2.3
REX3Q12090 RPS20YHL015W 366 nt0.68□□□□□ -2.3
REX3Q12090 YHL041WYHL041W 450 nt0.68□□□□□ -2.3
REX3Q12090 YPL185WYPL185W 396 nt0.68□□□□□ -2.3
REX3Q12090 NHP2YDL208W 471 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 QCR9YGR183C 201 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 MRPL50YNR022C 420 nt0.67□□□□□ -2.3
REX3Q12090 ATG31YDR022C 591 nt0.66□□□□□ -2.3
REX3Q12090 YAP6YDR259C 1152 nt0.66□□□□□ -2.3
REX3Q12090 YNL303WYNL303W 348 nt0.66□□□□□ -2.3
REX3Q12090 YPL044CYPL044C 549 nt0.66□□□□□ -2.3
REX3Q12090 NOP9YJL010C 2001 nt0.65□□□□□ -2.3
REX3Q12090 PCF11YDR228C 1881 nt0.65□□□□□ -2.3
REX3Q12090 BFR2YDR299W 1605 nt0.65□□□□□ -2.31
REX3Q12090 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.65□□□□□ -2.31
REX3Q12090 MAM33YIL070C 801 nt0.65□□□□□ -2.31
REX3Q12090 RKR1YMR247C 4689 nt0.65□□□□□ -2.31
REX3Q12090 RPL38YLR325C 237 nt0.64□□□□□ -2.31
REX3Q12090 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
REX3Q12090 TOM22YNL131W 459 nt0.64□□□□□ -2.31
REX3Q12090 UBC7YMR022W 498 nt0.63□□□□□ -2.31
REX3Q12090 NIP100YPL174C 2607 nt0.63□□□□□ -2.31
REX3Q12090 YCK3YER123W 1575 nt0.62□□□□□ -2.31
REX3Q12090 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.62□□□□□ -2.31
REX3Q12090 ISF1YMR081C 1017 nt0.62□□□□□ -2.31
REX3Q12090 NPR2YEL062W 1848 nt0.61□□□□□ -2.31
REX3Q12090 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.61□□□□□ -2.31
REX3Q12090 YDR344CYDR344C 444 nt0.6□□□□□ -2.31
REX3Q12090 YOR218CYOR218C 420 nt0.6□□□□□ -2.31
REX3Q12090 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.6□□□□□ -2.31
REX3Q12090 OLI1Q0130 231 nt0.59□□□□□ -2.31
REX3Q12090 RPS24BYIL069C 408 nt0.59□□□□□ -2.31
REX3Q12090 YOL014WYOL014W 375 nt0.59□□□□□ -2.31
REX3Q12090 CHS6YJL099W 2241 nt0.58□□□□□ -2.32
REX3Q12090 PAA1YDR071C 576 nt0.58□□□□□ -2.32
REX3Q12090 YJR011CYJR011C 786 nt0.58□□□□□ -2.32
REX3Q12090 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.58□□□□□ -2.32
REX3Q12090 ATP19YOL077W-A 207 nt0.58□□□□□ -2.32
REX3Q12090 YBR064WYBR064W 429 nt0.58□□□□□ -2.32
REX3Q12090 SPO21YOL091W 1830 nt0.57□□□□□ -2.32
REX3Q12090 ULP2YIL031W 3105 nt0.57□□□□□ -2.32
REX3Q12090 YLR456WYLR456W 615 nt0.57□□□□□ -2.32
REX3Q12090 YML002WYML002W 2214 nt0.57□□□□□ -2.32
REX3Q12090 UTP10YJL109C 5310 nt0.55□□□□□ -2.32
REX3Q12090 BSC3YLR465C 309 nt0.54□□□□□ -2.32
REX3Q12090 YBR206WYBR206W 324 nt0.54□□□□□ -2.32
REX3Q12090 PCC1YKR095W-A 267 nt0.53□□□□□ -2.32
REX3Q12090 MLP1YKR095W 5628 nt0.52□□□□□ -2.33
REX3Q12090 BEM3YPL115C 3387 nt0.52□□□□□ -2.33
REX3Q12090 RPL26BYGR034W 384 nt0.52□□□□□ -2.33
REX3Q12090 YKL063CYKL063C 504 nt0.52□□□□□ -2.33
REX3Q12090 BIR1YJR089W 2865 nt0.52□□□□□ -2.33
REX3Q12090 MCM10YIL150C 1716 nt0.52□□□□□ -2.33
REX3Q12090 HMRA2YCR096C 360 nt0.51□□□□□ -2.33
REX3Q12090 YDR426CYDR426C 378 nt0.51□□□□□ -2.33
REX3Q12090 FMP27YLR454W 7887 nt0.51□□□□□ -2.33
REX3Q12090 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.5□□□□□ -2.33
REX3Q12090 YJL007CYJL007C 315 nt0.5□□□□□ -2.33
REX3Q12090 AI1Q0050 2505 nt0.5□□□□□ -2.33
REX3Q12090 STE5YDR103W 2754 nt0.48□□□□□ -2.33
REX3Q12090 YOR053WYOR053W 342 nt0.48□□□□□ -2.33
REX3Q12090 IQG1YPL242C 4488 nt0.47□□□□□ -2.33
REX3Q12090 SEC8YPR055W 3198 nt0.47□□□□□ -2.33
REX3Q12090 FYV10YIL097W 1551 nt0.46□□□□□ -2.34
REX3Q12090 MLP2YIL149C 5040 nt0.45□□□□□ -2.34
REX3Q12090 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.45□□□□□ -2.34
REX3Q12090 TRS65YGR166W 1683 nt0.45□□□□□ -2.34
REX3Q12090 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.44□□□□□ -2.34
REX3Q12090 PET111YMR257C 2403 nt0.43□□□□□ -2.34
REX3Q12090 YSP1YHR155W 3687 nt0.43□□□□□ -2.34
REX3Q12090 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.42□□□□□ -2.34
REX3Q12090 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 145.7 ms