Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPP3CAQ08209 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms