Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC3A1Q07837 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms