Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCL9Q07325 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms