Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL16A1Q07092 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
COL16A1Q07092 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL16A1Q07092 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms