Protein–RNA interactions for Protein: Q05568

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, yeastyeast

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX10Q05568 RPS20YHL015W 366 nt0.69□□□□□ -2.3
PEX10Q05568 RPS24BYIL069C 408 nt0.69□□□□□ -2.3
PEX10Q05568 YLR202CYLR202C 327 nt0.69□□□□□ -2.3
PEX10Q05568 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.69□□□□□ -2.3
PEX10Q05568 YNL058CYNL058C 951 nt0.69□□□□□ -2.3
PEX10Q05568 IES4YOR189W 351 nt0.69□□□□□ -2.3
PEX10Q05568 YIR044CYIR044C 186 nt0.68□□□□□ -2.3
PEX10Q05568 Q0017Q0017 162 nt0.68□□□□□ -2.3
PEX10Q05568 ALG13YGL047W 609 nt0.67□□□□□ -2.3
PEX10Q05568 NHP2YDL208W 471 nt0.66□□□□□ -2.3
PEX10Q05568 YPL205CYPL205C 345 nt0.66□□□□□ -2.3
PEX10Q05568 YJL007CYJL007C 315 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YJR157WYJR157W 363 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 UTP20YBL004W 7482 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 DBP6YNR038W 1890 nt0.65□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YDR344CYDR344C 444 nt0.64□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YJR011CYJR011C 786 nt0.64□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YPL185WYPL185W 396 nt0.64□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 CUL3YGR003W 2235 nt0.64□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YDR521WYDR521W 336 nt0.63□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 MAM33YIL070C 801 nt0.63□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.63□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YDR426CYDR426C 378 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 PAU12YGR294W 363 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 RPL38YLR325C 237 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YLR434CYLR434C 384 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 RPS30BYOR182C 192 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YOR282WYOR282W 321 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YBR064WYBR064W 429 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 BFR2YDR299W 1605 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 NOP9YJL010C 2001 nt0.62□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 PMP1YCR024C-A 123 nt0.61□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 CMC4YMR194C-B 222 nt0.61□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YBR206WYBR206W 324 nt0.61□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YLL007CYLL007C 1998 nt0.61□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 ECM12YHR021W-A 456 nt0.6□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.6□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 INA22YIR024C 651 nt0.6□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.6□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.6□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.6□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 YCK3YER123W 1575 nt0.6□□□□□ -2.31
PEX10Q05568 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 YKL063CYKL063C 504 nt0.58□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.58□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 PTP2YOR208W 2253 nt0.57□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.57□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.57□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.57□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.57□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 YBR285WYBR285W 435 nt0.57□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 OST1YJL002C 1431 nt0.56□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.56□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 ASE1YOR058C 2658 nt0.56□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 LTE1YAL024C 4308 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 PRM3YPL192C 402 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 YMR160WYMR160W 2451 nt0.55□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 CHS6YJL099W 2241 nt0.54□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 OLI1Q0130 231 nt0.54□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 Q0144Q0144 330 nt0.54□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 QCR9YGR183C 201 nt0.54□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 PCC1YKR095W-A 267 nt0.54□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 VPS20YMR077C 666 nt0.54□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 MCM10YIL150C 1716 nt0.54□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 YSP1YHR155W 3687 nt0.53□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 AGA2YGL032C 264 nt0.53□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 YNL324WYNL324W 396 nt0.53□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 YPL044CYPL044C 549 nt0.53□□□□□ -2.32
PEX10Q05568 YML002WYML002W 2214 nt0.52□□□□□ -2.33
PEX10Q05568 CSN9YDR179C 489 nt0.52□□□□□ -2.33
PEX10Q05568 YER079WYER079W 633 nt0.52□□□□□ -2.33
PEX10Q05568 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.52□□□□□ -2.33
PEX10Q05568 NPR2YEL062W 1848 nt0.51□□□□□ -2.33
PEX10Q05568 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.51□□□□□ -2.33
PEX10Q05568 YOR053WYOR053W 342 nt0.51□□□□□ -2.33
PEX10Q05568 YAR029WYAR029W 225 nt0.5□□□□□ -2.33
PEX10Q05568 BSC3YLR465C 309 nt0.49□□□□□ -2.33
PEX10Q05568 YOL014WYOL014W 375 nt0.49□□□□□ -2.33
PEX10Q05568 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.49□□□□□ -2.33
PEX10Q05568 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.48□□□□□ -2.33
PEX10Q05568 YAR053WYAR053W 297 nt0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.8 ms