Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB3Q04118 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms