Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYP4A11Q02928 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms