Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms