Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms