Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113P62684 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113P62684 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms