Protein–RNA interactions for Protein: P56556

NDUFA6, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA6P56556 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA6P56556 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA6P56556 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA6P56556 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA6P56556 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA6P56556 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA6P56556 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms