Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC13P55735 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC13P55735 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC13P55735 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC13P55735 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC13P55735 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC13P55735 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC13P55735 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC13P55735 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC13P55735 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC13P55735 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC13P55735 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC13P55735 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms