Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF1P55201 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms