Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SMARCA2P51531 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SMARCA2P51531 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms