Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TTPAP49638 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TTPAP49638 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TTPAP49638 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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