Protein–RNA interactions for Protein: P47078

YJL009W, Uncharacterized protein YJL009W, yeastyeast

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL009WP47078 snR13snR13 124 nt0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YBR206WYBR206W 324 nt0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 INP2YMR163C 2118 nt0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 VIK1YPL253C 1944 nt0.01□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 COX12YLR038C 252 nt0.01□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YPL261CYPL261C 309 nt0.01□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 OLI1Q0130 231 nt0□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 EMC4YGL231C 573 nt0□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 HAL9YOL089C 3093 nt-0□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 ORC3YLL004W 1851 nt-0.01□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 SNU56YDR240C 1479 nt-0.01□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 OST4YDL232W 111 nt-0.01□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YDR029WYDR029W 315 nt-0.01□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 ILM1YJR118C 612 nt-0.01□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YMR321CYMR321C 318 nt-0.01□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 GRX5YPL059W 453 nt-0.01□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YPL185WYPL185W 396 nt-0.01□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 EFR3YMR212C 2349 nt-0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 PRP21YJL203W 843 nt-0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YOR053WYOR053W 342 nt-0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.02□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YJR011CYJR011C 786 nt-0.03□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 THO2YNL139C 4794 nt-0.03□□□□□ -2.41
YJL009WP47078 YAP6YDR259C 1152 nt-0.04□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YKL202WYKL202W 582 nt-0.04□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 DCP1YOL149W 696 nt-0.04□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 RPB10YOR210W 213 nt-0.04□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 snR190snR190 190 nt-0.04□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 NIP100YPL174C 2607 nt-0.05□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YDL016CYDL016C 303 nt-0.05□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.05□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 NFU1YKL040C 771 nt-0.05□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YOR345CYOR345C 351 nt-0.05□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.06□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 snR45snR45 172 nt-0.06□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 snR51snR51 107 nt-0.06□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 PRP42YDR235W 1635 nt-0.06□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.07□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 RPS20YHL015W 366 nt-0.07□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 COX5BYIL111W 456 nt-0.07□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 BER1YLR412W 825 nt-0.07□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YML108WYML108W 318 nt-0.07□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 LEE1YPL054W 906 nt-0.07□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 SVS1YPL163C 783 nt-0.07□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YPL182CYPL182C 384 nt-0.07□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-0.08□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 MATALPHA2YCR039C 633 nt-0.08□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 RPS26AYGL189C 360 nt-0.08□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YLR232WYLR232W 348 nt-0.08□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 MLP1YKR095W 5628 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YCR001WYCR001W 315 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 SSS1YDR086C 243 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 SDH7YDR511W 402 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 TIM13YGR181W 318 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YIR044CYIR044C 186 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 RPS27AYKL156W 249 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 PBI2YNL015W 228 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 YNL211CYNL211C 261 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 SOV1YMR066W 2697 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 COY1YKL179C 2040 nt-0.09□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 MLP2YIL149C 5040 nt-0.1□□□□□ -2.42
YJL009WP47078 CUL3YGR003W 2235 nt-0.1□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 ULI1YFR026C 510 nt-0.1□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 MAM33YIL070C 801 nt-0.1□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 ISF1YMR081C 1017 nt-0.1□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 MRPL50YNR022C 420 nt-0.1□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 TSC3YBR058C-A 243 nt-0.1□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 YNL146WYNL146W 303 nt-0.11□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 BUL2YML111W 2763 nt-0.12□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 YLR171WYLR171W 390 nt-0.12□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-0.12□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.13□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 PAA1YDR071C 576 nt-0.13□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.13□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.13□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 COG8YML071C 1824 nt-0.13□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 RPL35AYDL191W 363 nt-0.14□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.14□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.14□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 YDL011CYDL011C 324 nt-0.15□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 YHL041WYHL041W 450 nt-0.15□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 Q0255Q0255 1419 nt-0.15□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 SPO21YOL091W 1830 nt-0.15□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 NIP1YMR309C 2439 nt-0.16□□□□□ -2.43
YJL009WP47078 YAR053WYAR053W 297 nt-0.16□□□□□ -2.44
YJL009WP47078 YLR269CYLR269C 351 nt-0.16□□□□□ -2.44
YJL009WP47078 ATG31YDR022C 591 nt-0.17□□□□□ -2.44
YJL009WP47078 NNF2YGR089W 2811 nt-0.17□□□□□ -2.44
YJL009WP47078 PTP2YOR208W 2253 nt-0.18□□□□□ -2.44
YJL009WP47078 YBL071CYBL071C 309 nt-0.18□□□□□ -2.44
YJL009WP47078 RPF1YHR088W 888 nt-0.19□□□□□ -2.44
YJL009WP47078 YKU70YMR284W 1809 nt-0.2□□□□□ -2.44
YJL009WP47078 PRP39YML046W 1890 nt-0.2□□□□□ -2.44
YJL009WP47078 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.2□□□□□ -2.44
YJL009WP47078 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-0.2□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms