Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACAA2P42765 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms