Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNA3P32297 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms