Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
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PTPRMP28827 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
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PTPRMP28827 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
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PTPRMP28827 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
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PTPRMP28827 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
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PTPRMP28827 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
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PTPRMP28827 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
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PTPRMP28827 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRMP28827 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
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