Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms