Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF3P20783 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF3P20783 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF3P20783 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 439.9 ms