Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XBP1P17861 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XBP1P17861 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XBP1P17861 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XBP1P17861 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XBP1P17861 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XBP1P17861 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms