Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCFC2P16383 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms